Dans la série, Joe interprête le rôle du courageux et désobéissant Lt Colonel John Sheppard qui devient membre de l'expédition d'Atlantis quand Weir découvre qu'il est capable d'accéder à la technologie des Anciens et ce car il possède le gène en question.
Né à Los Angeles le 5 janvier 1967, Joe Flanigan déménage dans un petit ranch dans la ville retirée de Reno, dans le Nevada alors qu'il n'avait que 6 ans. Il rentre alors à l'école d'Ojai, en Californie, et plus tard, il reçoit une maîtrise d'Histoire de l'Université du Colorado. Il passe ensuite une année à Paris, où il va occuper le poste de journaliste. L'année suivante, il retourne aux Etats-Unis où il décide d'étudier le métier d'acteur à la très célébre " Neighbourhood Playhouse " située à New York.
En 1994, il retourne dans sa ville natale, Los Angeles, et débute sa carrière d'acteur en jouant aux côtés de Jacqueline Smith dans une mini-serie de la chaîne NBC, intitulée en version originale "Family Album". Il a ensuite eu des règles plus réguliers dans des séries comme " Sisters " ou encore " Profiler " et obtient quelques rôles en tant qu'invité dans plusieurs autres séries telles " Birds Of Prey ", " Judging Amy " ou encore " Murphy Brown " où il interpréta le rôle de Scott.
Il fait ensuite plusieurs apparitions et réapparitions dans " Providence", " CSI : Miami " et " Dawson's Creek" ainsi que " Tru Calling ". Il devrait être très prochainement à l'affiche d'un tout nouveau film réalisé par Breck Eisner, intitulé " Thought Crimes ".
Ajoutons à ce talentueux parcours la passion exceptionnelle de Joe pour le ski, qu'il pratique depuis de nombreuses années, mais aussi le surf et l'escalade.
Aujourd'hui, il habite à Vancouver avec sa femme et ses 3 enfants.
